diff --git a/Article/article.tex b/Article/article.tex index 785f1a902b99deaa022303bba1d70078b4e3d8d7..01649e4c7265f14b37926d7c25b2410171789d9c 100644 --- a/Article/article.tex +++ b/Article/article.tex @@ -140,16 +140,20 @@ Voici comment sont déterminés les paramètres ($||x||$ correspond à la valeur \newpage \subsection{Premier modèle d'évolution : SIR} -Voici les différentes équations régissant l'évolution pas à pas du système (tout d'abord sans l'incubation): +Le modéle SIR est le modéle fondamental dans l'étude compartimental en épidémiologie\cite{sir-model}. +Voici les différentes équations régissant l'évolution pas à pas du système (tout d'abord sans incubation): \begin{itemize} \item $s_{k+1} = (-death_{nat}-p.\frac{i_k}{s_k+i_k+r_k})s_k + loss.r_k + birth(s_k+i_k+r_k)$ \item $i_{k+1} = p.\frac{i_k}{s_k+i_k+r_k}.s_k + (-death_{ill}-R)i_k$ \item $r_{k+1} = vacc_{rate}.s_k + R.i_k + (1-death_{nat}-loss)r_k$ \end{itemize} -% En particulier, le terme $p.\frac{i_k}{s_k+i_k+r_k}.s_k$ correspond à la transmission de la maladie. Il est important de noter qu'il dépend à la fois du nombre -% de personnes susceptibles, mais aussi de la proportion de personnes infectées parmis la population. Cela pose un problème car ce terme rend le système non-linéaire. -Le terme $s_k.(1-\frac{\gamma.p}{N})^I$ représente la transmission du virus. -Voici comment obtenir cette formule : + +En particulier, le terme $p.\frac{i_k}{s_k+i_k+r_k}.s_k$ correspond à la transmission de la maladie. Il est important de noter qu'il dépend à la fois du nombre +de personnes susceptibles, mais aussi de la proportion de personnes infectées parmis la population. Cela pose un problème car ce terme rend le système non-linéaire. + +Dans la recherche d'une modélisation plus proche de la réalité, nous avons pensé à une autre formule concernant la transmission du virus. + +On procéde ainsi : \begin{itemize} \item Un individu infecté effectue $\gamma$ contacts par jour, donc seule une proportion $p$ est susceptible de transùettre la maladie. \item Parmis ces contacts, seuls $\frac{S}{N}$ atteignent des personnes saines. On a donc $\frac{\gamma.p.S}{N}$ transmissions par individu infecté. @@ -158,6 +162,12 @@ Voici comment obtenir cette formule : \item Enfin, on a donc $S.P^{i_k}$ personnes saines qui sont infectées à chaque pas. \end{itemize} +Le terme $s_k.(1-\frac{\gamma.p}{N})^I$ représente donc la transmission du virus. +On a alors : +\begin{itemize} + \item $s_{k+1} = (-death_{nat}-(1-\frac{\gamma.p}{N})^I)s_k + loss.r_k + birth(s_k+i_k+r_k)$ +\end{itemize} + \newpage \subsection{Second modèle d'évolution : SEIR} On peut ensuite introduire dans notre modèle le phénomène d'incubation. Pour cela, on doit utiliser des variables stockant les personnes à différents stades de diff --git a/Figures/base_infection_first_result.png b/Figures/base_infection_first_result.png new file mode 100644 index 0000000000000000000000000000000000000000..93c1ff3730b7e23b97fedb72e682f85a1554099d Binary files /dev/null and b/Figures/base_infection_first_result.png differ diff --git a/SRI_matlab/main.m b/SRI_matlab/main.m index fb9df2e2988780b5e14ee61519d76975008cda3d..ef695d13033cbc640269f5d76a2325404385055a 100644 --- a/SRI_matlab/main.m +++ b/SRI_matlab/main.m @@ -18,7 +18,7 @@ coeffs.QuarantineRate = 0; VaccinationVector = build_vacc_rate(0, 0, 0, N); % VaccinationVector = build_vacc_rate(0, 0, 50, N); -m = model(S, I, Q, R, 1, N); +m = model(S, I, Q, R, 0, N); t = 1:N; diff --git a/SRI_matlab/step.m b/SRI_matlab/step.m index c874baf51a46aa0b4b42337e4b2b3f37007d45b4..2353e56c81db450dcddd70cf04d69207fe323842 100644 --- a/SRI_matlab/step.m +++ b/SRI_matlab/step.m @@ -12,9 +12,9 @@ for i=6:length(X) end if length(X) > 4 - infection = S * (1 - 25 * options.InfectionRate / N) ^ I; - % infecter = sum(X(5:length(X)) + I); - % infection = options.InfectionRate * S * infecter/N; + % infection = S * (1 - 25 * options.InfectionRate / N) ^ I; + infecter = sum(X(5:length(X)) + I); + infection = options.InfectionRate * S * infecter/N; new_waiting(1) = infection; dS = -infection; dI = X(length(X));